Aide à la Physique Chimie au Lycée

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Aide à la Physique Chimie au Lycée

Starlink SPLAT-VO

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SPLAT - Spectral Analysis Tool: http://star-www.dur.ac.uk/~pdraper/splat/splat-vo/

http://star-www.dur.ac.uk/~pdraper/splat/splat-vo/

SPLAT is a graphical tool for displaying, comparing, modifying and analysing astronomical spectra stored in NDF, FITS and TEXT files as well as the new NDX format. SPLAT is now part of the STARJAVA collection.

It can read in many spectra at the same time and then display these as line plots. Each display window, of which there can be many, can be used to view one or several spectra at the same time. Display windows can be interactively zoomed and scrolled, centered on specific wavelengths, provide continuous coordinate readout, produce printable hardcopy and be configured in many ways. They also provide the basis for interactive analysis facilities. All of these functions are displayed in a visually rich format, that is intended to appeal especially to casual users of spectral data analysis facilities, as it includes some facilities such as drag-and-drop and undoable editing.

The current set of analysis facilities include the fitting of a polynomial to selected parts of a spectrum, the fitting of Gaussian, Lorentzian and Voigt profiles to emission and absorption lines and the filtering of spectra using average, median and line-shape window functions as well as wavelet denoising. A database of laboratory line positions is available to aid in identification.

SPLAT also supports a full range of coordinate systems for spectra, using the latest facilities of the Starlink AST library. This allows coordinates to be displayed and aligned in many different coordinate systems (wavelength, frequency, energy, velocity) and transformed between these and different standards of rest (topocentric, heliocentric, dynamic and kinematic local standards of rest etc.).

The Starlink Spectral Analysis Tool (SPLAT) has been upgraded to include a toolbox for querying, downloading and displaying spectra from the current generation of SSAP servers. This is now part of the official SPLAT release, which comes with JAC Starlink.

More recently SPLAT has been updated (by Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. ) so that it can interoperate with other SAMP aware applications, such as TOPCAT and the SSAP support has been updated to version 1.0. This version is available here.

http://star-www.dur.ac.uk/~pdraper/splat/splat-vo/

Questions or comments to: Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. .

This latest version of SPLAT is available as a download for installing onto your desktop:

SPLAT-VO installer (100Mb)

or as a webstart application:

SPLAT-VO webstart

The changes are described in the NEWS file.

Both versions will run using Linux (glibc2.3), Windows (XP/Vista 32bit), Mac OS X (10.4 ppc & 10.4 i386) and Solaris (8+). The installer is an executable jar file so you just need to run this using the command:

 

java -jar splat-vo.jar

After downloading it. If you install SPLAT-VO locally then it may integrate into your desktop or alternatively (for UNIX only) you can run it by executing the splat script located in the <root>/bin/splat directory.

Vista users should note that the installer will not install into system directories. Use a user-specific directory instead.

SPLAT-VO is part of the Starlink STARJAVA package and is available under the GPL.

The complete documentation (which is also available in the on-line help) is available as SUN/243

Highlights of these changes, besides being able to make SSAP queries, are the matching of spectral coordinates and fluxes between spectra. Spectral coordinates include the full range described in FITS WCS Paper III, that is wavelength, frequency, energy and velocity etc. These can be described in various rest frames -- topocentric, heliocentric, dynamic and kinematic local -- and can be transformed between them all.

Differences between data value units can be automatically taken account of when overlaying spectra as long as the units strings conform to the system described in FITS WCS paper I. Also, automatic identification and conversion between flux per unit wavelength and flux per unit frequency is provided and does not require any "dimensional analysis" information to be present

These two systems will be extended to include others such as magnitude and antenna temperature that require additional meta-data to fully describe the inter-system transformations. All coordinate and flux transformations are handled by the Starlink AST package, developed by Rodney Warren-Smith and David Berry ( Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. ). AST also provides the plotting facilities used for drawing spectra in SPLAT-VO.

Questions or comments to: Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. .

Mise à jour le Jeudi, 21 Juin 2012 11:43
 

Explorateur de spectres

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L'Explorateur de spectre est un programme Java qui vous permet de tracer et de comparer un certain nombre de spectres différents, y compris noir et les données stellaires.

Téléchargement :http://r.chouchi.free.fr//telechargement/spectrumexplorer.zip

Téléchargement :http://r.chouchi.free.fr//telechargement/spectrumexplorer.zip

Mise à jour le Dimanche, 28 Janvier 2024 16:05
 

Latex MiKTeX, WinShell , TeXnicCenter et TexMaker

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Latex MiKTeX, WinShell , TeXnicCenter et TexMaker
Qu'est ce que PostScript ?
C'est un format de fichier rendant possible sa lecture par des imprimantes sans l'intermédiaire d'un pc, chose que les .pdf ou les .doc générés par Word ne savent pas faire. Il a beaucoup d'avantages et est très utilisé au sein des laboratoires de recherches.

Un livre électronique sur le Latex : http://www.framabook.org/docs/latex/framabook5_latex_v1_art-libre.pdf

L'installation du logicielle pour LaTeX sur Windows se déroulera en trois temps:
MiKTeX, la distribution LaTeX
Il faut installer MiKTeX : http://miktex.org/
Ghostscript et Adobe Reader ou Foxit Reader, vos lecteurs de postscript et de pdf
Il faut installer un lecteur de postscript ainsi qu’un lecteur de pdf sur votre ordinateur, de sorte que vous puissiez :
- manipuler les fichiers PS (diminutif de postscript)
- transformer les fichiers PS en pdf
- lire les .ps
- lire les .pdf

Ghostscript : http://www.ghostscript.com/download/
Pour ce qui est des .ps, téléchargez le logiciel Ghostscript et l'installer:

Adobe Reader ou Foxit Reader
Les .pdf se lisent la plupart du temps avec Adobe Reader ou Foxit Reader (plus petit d'un facteur 10 ) : http://www.foxitsoftware.com/downloads/thanks.php?product=Foxit-Reader&platform=Windows

TeXnicCenter ou Winshell, L'interface graphique
WinShell ou TeXnicCenter peut-être votre interface graphique :

WinShell
Cet éditeur est disponible à l’adresse http ://www.winshell.de/.
Avantages :
– Simplicité d’utilisation
– Interface disponible en français
– Aide à la réalisation de tableaux
– Coloration syntaxique
– Création de macros
Inconvénients :
– Pas de localisation des erreurs et des avertissements autrement qu’en lisant le fichier .log

TeXnicCenter ( une petite apparence de WORD )
Installation et configuration
Il est téléchargeable à l’adresse http ://www.toolscenter.org/products/texniccenter/.
Avantages :
– Simplicité d’utilisation
– Palettes nombreuses (mathématiques, environnements, . . . )
– Coloration syntaxique
– Localisation des erreurs et des avertissements
Inconvénients :
– Interface en anglais
– Pas de création de macros

Texmaker est un éditeur LaTeX libre et gratuit avec support de l'unicode, correction orthographique, auto-complétion et repliage de code. Il intègre un afficheur pdf intégré avec support pour Sync Tex et affichage en mode continu.
Texmaker est multi-plateforme : il fonctionne sur linux, macosx et windows.

L'extension Package manager de Miktex permets d'ajouter des extensions pour la physique, chimie et maths....
Vous avez le catalogue des extensions :
http://texcatalogue.sarovar.org/bytopic.html
pour la chimie
http://texcatalogue.sarovar.org/bytopic.html#chem
pour les maths
http://texcatalogue.sarovar.org/bytopic.html#math

Exemples:
QCM avec l'extension (alterqcm) : http://altermundus.fr/pages/alterqcm.html
Pour la chimie :
http://fr.wikibooks.org/wiki/LaTe/%C3%89crire_des_formules_chimiques
http://fr.wikibooks.org/wiki/LaTeX/Dessiner_avec_LaTeX/Dessiner_des_mol%C3%A9cules
http://texcatalogue.sarovar.org/bytopic.html#chem

Réalisation de graphiques mathématiques :
http://fr.wikibooks.org/wiki/Programmation_LaTeX/Dessiner_avec_LaTeX/R%C3%A9alisation_de_graphiques_math%C3%A9matiques
Texmaker est simple à utiliser et à configurer.
http://www.xm1math.net/texmaker/download_fr.html#windows
Aides :
http://www.xm1math.net/doculatex/index.html
http://www.ann.jussieu.fr/hecht/ftp/old/InfoBase-2005-06/latex/DOC/LaTex-initiation.pdf
http://fr.wikibooks.org/wiki/LaTeX/Math%C3%A9matiques
http://texcatalogue.sarovar.org/bytopic.html

 

Logiciel moléculaire

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Logiciels de visualisation

Logiciel

Site

Commentaire

RasMol

http://www.openrasmol.org/

Gratuit

VMD

http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/

Gratuit

PyMol

http://www.pymol.org/

Gratuit/Payant suivant version

Swiss PDB viewer

http://spdbv.vital-it.ch/

Gratuit

Chimera

http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/

Gratuit

DS Visualizer

http://accelrys.com/products/discovery-studio/visualization/discovery-studio-visualizer.html

Gratuit

Marvin

http://www.chemaxon.com/product/marvin_land.html

Gratuit pour les académiques

Molsoft

http://www.molsoft.com/

Gratuit/Payant suivant version

Ligand Explorer

Téléchargement

http://pdbbeta.rcsb.org/pdb/explore/viewerLaunch.do?viewerType=LX&structureId=1QM6&

Gratuit

Jmol

http://jmol.sourceforge.net/

Gratuit

Avogadro

http://avogadro.openmolecules.net/wiki/Get_Avogadro

Gratuit

Docking

Autodock

http://autodock.scripps.edu/

Gratuit

UCSF Dock

http://dock.compbio.ucsf.edu/

Gratuit

Fitted

http://fitted.ca/

Gratuit pour les académiques

Calcul des propriétés physico-chimiques

Marvin

http://www.chemaxon.com/product/marvin_land.html

Gratuit pour les académiques

ChemToolBox

http://chemtoolbox.free.fr/index_fr.php

Gratuit

Conversion entre formats de fichiers

Openbabel

http://openbabel.org/wiki/Main_Page

Gratuit

PDF Creator

http://sourceforge.net/projects/pdfcreator/

Gratuit

Serveurs

Molecular Docking Server

http://www.dockingserver.com/web/

Gratuit pour les académiques



Mise à jour le Mercredi, 23 Mai 2012 05:43
 

Marvin

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MarvinSketch est un des logiciels gratuits proposé par la société Chemaxon. Il permet de dessiner toutes les molécules possibles et imaginables, les réactions les plus complexes, en un coup de souris.

Toutes les options des logiciels professionnels y sont, jusqu'à la représentation en 3 dimensions.

Vous pouvez créer vos molécules et les visualiser en 3D.

Il y a en plus des extensions comme :NMR prediction http://www.chemaxon.com/marvin/help/calculations/nmrpredict.html

Pour faire un test sans installation : https://www.chemaxon.com/marvin/sketch/index.php

Vous pouvez enregistrer les molécules au format mol pour les visualiser dans JMol ou Rasmol .....

Mise à jour le Mardi, 22 Mai 2012 06:36
 


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